20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5215 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  66.89 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  36.47 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  28.75 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  27.22 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  25.81 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  32.56 
 
 		 657 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  25.81 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  25.29 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  29.3 
 
 		 163 aa  52  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  31.9 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  25.61 
 
 		 165 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  25.31 
 
 		 167 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2305  putative integral membrane protein  43.96 
 
 		 167 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  26.8 
 
 		 168 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  25.41 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  31 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21610  hypothetical protein  32.74 
 
 		 147 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.281638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  30.11 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  26.11 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>