31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5183 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  80.27 
 
 		 327 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  46.18 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  40.71 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  46.55 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  40.29 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  39.58 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  46.22 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  51.97 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  40.86 
 
 		 451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  43.01 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  33.97 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  39.41 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  36.62 
 
 		 320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  38.34 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  40.93 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  24.42 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  22.82 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  30.04 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  24.14 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  22.95 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  20.66 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  28.34 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0140  hypothetical protein  25.81 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.89303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  27.31 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  20.47 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05521  hypothetical protein  18.04 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  38.71 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  24.37 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  23.63 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  28.89 
 
 		 293 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>