More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4979 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  81.3 
 
 		 231 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.61 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 224 aa  294  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  69.23 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 212 aa  285  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  70.87 
 
 		 212 aa  285  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  68.27 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 213 aa  274  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  67.48 
 
 		 216 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  66.83 
 
 		 216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  66.99 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  68.69 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  62.91 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.67 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  64.65 
 
 		 213 aa  258  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.08 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.98 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.15 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  66.99 
 
 		 225 aa  251  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.73 
 
 		 218 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.65 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.31 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.22 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  58.45 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  58.94 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  58.65 
 
 		 214 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  63.51 
 
 		 223 aa  234  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 216 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.94 
 
 		 218 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 215 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 215 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.89 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.07 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  59.71 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.25 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.05 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  41.75 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.47 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  41.36 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  42.31 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.32 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.22 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  40.28 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  43.18 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>