More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4910 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
552 aa  1058    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.25 
 
 
737 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  40.06 
 
 
892 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 
863 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  45.4 
 
 
719 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  44.29 
 
 
518 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 
807 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  42.65 
 
 
772 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.11 
 
 
716 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
770 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.57 
 
 
682 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
756 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  37.85 
 
 
295 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
850 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.62 
 
 
682 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
583 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.57 
 
 
650 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  34.57 
 
 
572 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 
607 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
715 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.28 
 
 
632 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.92 
 
 
746 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.44 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  33.44 
 
 
1032 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  33.44 
 
 
1032 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  34.65 
 
 
1018 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 
600 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  37.8 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  32.12 
 
 
951 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.7 
 
 
593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.71 
 
 
602 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.52 
 
 
517 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.69 
 
 
916 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
626 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
895 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
612 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.04 
 
 
627 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 
862 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
691 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.41 
 
 
661 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
543 aa  113  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  27.21 
 
 
700 aa  113  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
585 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
763 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.72 
 
 
692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.97 
 
 
880 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.82 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.89 
 
 
863 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  30.32 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.75 
 
 
627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.44 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
455 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.97 
 
 
822 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  33.55 
 
 
462 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.3 
 
 
445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.75 
 
 
499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
661 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
628 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  30.54 
 
 
1057 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.72 
 
 
591 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.51 
 
 
843 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
894 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
368 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  27.86 
 
 
638 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.6 
 
 
620 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
468 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  28.3 
 
 
454 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  32.12 
 
 
896 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
938 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
666 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.6 
 
 
621 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  31.74 
 
 
1053 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  31.38 
 
 
661 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.15 
 
 
971 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7753  serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 
489 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.95 
 
 
528 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
618 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  34.9 
 
 
706 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
915 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
776 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.1 
 
 
650 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.43 
 
 
551 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.6 
 
 
540 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
619 aa  107  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
612 aa  107  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
497 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
538 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.93 
 
 
715 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.22 
 
 
625 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.26 
 
 
668 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.84 
 
 
769 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
646 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
989 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 
647 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.08 
 
 
675 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 
891 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>