More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4903 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  926    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  85.94 
 
 
452 aa  774    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  66.9 
 
 
433 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  66.13 
 
 
432 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  65.97 
 
 
440 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  66.9 
 
 
435 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  65.22 
 
 
442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  66.9 
 
 
440 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  66.2 
 
 
442 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  65.03 
 
 
442 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  64.83 
 
 
443 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  62.21 
 
 
443 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  61.92 
 
 
434 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  62 
 
 
439 aa  525  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  62.15 
 
 
429 aa  524  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  61.75 
 
 
442 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  59.4 
 
 
441 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  59.03 
 
 
446 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  59.91 
 
 
438 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  59.26 
 
 
450 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  60 
 
 
451 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  59.77 
 
 
445 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  57.28 
 
 
434 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  56.95 
 
 
448 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  60.42 
 
 
444 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  60.42 
 
 
444 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  60.42 
 
 
444 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  58.74 
 
 
444 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  56.5 
 
 
449 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  55.02 
 
 
446 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  59.72 
 
 
430 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  55.63 
 
 
434 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  57.31 
 
 
444 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  54.46 
 
 
421 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  54.44 
 
 
434 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  56.47 
 
 
428 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  53.23 
 
 
437 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  53.15 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  51.4 
 
 
439 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  48.53 
 
 
451 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  50.22 
 
 
468 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  47.63 
 
 
468 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  34.88 
 
 
434 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  32.41 
 
 
473 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.61 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.67 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  28.85 
 
 
478 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.78 
 
 
468 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  27.73 
 
 
485 aa  146  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  29.88 
 
 
494 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.62 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  31.78 
 
 
497 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  30.21 
 
 
487 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  26.5 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.6 
 
 
493 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.54 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  29.67 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.82 
 
 
493 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.85 
 
 
457 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.21 
 
 
476 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.68 
 
 
508 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.63 
 
 
493 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.12 
 
 
549 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  23.75 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.73 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  26.85 
 
 
491 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25.53 
 
 
395 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  27.86 
 
 
510 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 
433 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
388 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.16 
 
 
465 aa  104  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.5 
 
 
494 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.34 
 
 
393 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.24 
 
 
440 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.29 
 
 
390 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  26.67 
 
 
507 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  26.67 
 
 
507 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.77 
 
 
373 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.73 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.28 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  27.05 
 
 
410 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.67 
 
 
374 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.78 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  24.37 
 
 
490 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  23.59 
 
 
407 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  24.24 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  28.18 
 
 
406 aa  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  23.58 
 
 
411 aa  89.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.16 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  27.7 
 
 
581 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  26.29 
 
 
409 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  23.33 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  32.14 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.81 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  27.69 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.32 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  24.24 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  27.29 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  25.87 
 
 
413 aa  84  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>