More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4894 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  81.19 
 
 		 275 aa  359  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  59.05 
 
 		 233 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  59.83 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  59.75 
 
 		 233 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  55.42 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  58.3 
 
 		 236 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  53.91 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  52.82 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  58.14 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  53.18 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  50.63 
 
 		 234 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  46.86 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  50.82 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  49.17 
 
 		 234 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 238 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 238 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 238 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  48.55 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  50.62 
 
 		 228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  46.69 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  48.56 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  51.05 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  45.87 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  47.47 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  46.37 
 
 		 235 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  48.2 
 
 		 235 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  46.54 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.92 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 204 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 199 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 207 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 209 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 200 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 201 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 199 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.21 
 
 		 205 aa  85.5  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  34.31 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.72 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 411 aa  75.5  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.35 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 195 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.7 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.7 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.7 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.55 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.47 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.94 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  27.98 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 440 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.49 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.76 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  26.69 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.34 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>