168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4861 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  100 
 
 		 472 aa  920    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  76.7 
 
 		 341 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  46.05 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2095  hypothetical protein  86.55 
 
 		 122 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  32.08 
 
 		 436 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  31.11 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  30.53 
 
 		 430 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  30.53 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  29.93 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  27.49 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  27.49 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  30.28 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  30.28 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  29.95 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  29.97 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  30.56 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  30.56 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  28.28 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  27.42 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  27.21 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  29.11 
 
 		 546 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  27.98 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  38.94 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  28.53 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  30.77 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  28.41 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  28.41 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  30.16 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 561 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  30.19 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  26.18 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  40.76 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  50 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  42.42 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  34.56 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  46.39 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.29 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  36.89 
 
 		 620 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.25 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  54.93 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  32.41 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  42.7 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  37.59 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  37.39 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  36.52 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  33.33 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  31.65 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  32.35 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.29 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  28.46 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  41.41 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  35.38 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  29.02 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  41.41 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  41.41 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  43.01 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  44.59 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  45.95 
 
 		 532 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  44.59 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  27.47 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  36.73 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  26.13 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.7 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  26.61 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  28.27 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.92 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.44 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  29.96 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  32.43 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  37.86 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.84 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2722  HNH nuclease  34.58 
 
 		 571 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4442  HNH endonuclease  35.16 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  31.05 
 
 		 526 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.13 
 
 		 558 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  31.96 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1738  HNH nuclease  40 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.425954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  30.54 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  28.71 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  30.56 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  29.45 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2101  HNH nuclease  35.29 
 
 		 576 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 628 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  24.87 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0743  hypothetical protein  39.39 
 
 		 553 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  43.66 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  40.86 
 
 		 558 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>