262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4855 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  94.31 
 
 		 404 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  100 
 
 		 403 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  75.68 
 
 		 402 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  68.73 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  68.73 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  68.73 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  68.07 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  66.34 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  58.37 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  54.93 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  54.3 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  55 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  54.59 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  54.46 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  54.46 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  53.94 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  54.46 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  41.03 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.69 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  39.42 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  37.31 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  35.14 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.85 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  38.77 
 
 		 431 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  38.34 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  35.89 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  37.3 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  36.43 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  39.15 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  38.21 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.7 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  37.44 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.93 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  37.53 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  36.06 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  37.68 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  36.72 
 
 		 438 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  36.86 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.29 
 
 		 437 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  34.99 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  35.01 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.05 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.59 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  33.74 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.61 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  35.29 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.43 
 
 		 426 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  32.45 
 
 		 423 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.46 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  32.12 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  35.28 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  33.5 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33.86 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.68 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  32.17 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.25 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.58 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  31.16 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.48 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.54 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.64 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  32.25 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.28 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.73 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  33.33 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  32.24 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  30.28 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  31.08 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.01 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  29.52 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  31.3 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.43 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.04 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.49 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  31.35 
 
 		 470 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.33 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  30.83 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.49 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.2 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  30.79 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  29.95 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  31.41 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  31.05 
 
 		 445 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  29.04 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.74 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  31.02 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.93 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.93 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.93 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  30.95 
 
 		 411 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  31.89 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 		 445 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.44 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  30.08 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  30.08 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.35 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  30.21 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  29.5 
 
 		 478 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  32.78 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  29.17 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>