More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4764 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  87.3 
 
 
235 aa  327  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  78.89 
 
 
183 aa  280  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  75.98 
 
 
186 aa  277  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  75.56 
 
 
186 aa  274  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  72.78 
 
 
186 aa  268  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  72.78 
 
 
201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  72.78 
 
 
201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  71.67 
 
 
186 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  71.67 
 
 
186 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  71.67 
 
 
186 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  72.22 
 
 
186 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  69.44 
 
 
186 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  69.44 
 
 
186 aa  261  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  72.07 
 
 
205 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  69.83 
 
 
185 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  70.39 
 
 
185 aa  255  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  70.39 
 
 
185 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  70.39 
 
 
185 aa  255  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  70.39 
 
 
185 aa  255  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  70.39 
 
 
185 aa  255  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  68.89 
 
 
186 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  68.89 
 
 
186 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  71.51 
 
 
188 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  69.27 
 
 
188 aa  246  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  65.56 
 
 
184 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 
192 aa  241  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  63.33 
 
 
188 aa  239  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  63.39 
 
 
191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  64.84 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  62.71 
 
 
184 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  56.91 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  59.32 
 
 
187 aa  205  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  54.6 
 
 
187 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  57.54 
 
 
188 aa  191  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  57.54 
 
 
188 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  74.02 
 
 
129 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 
192 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  48.28 
 
 
183 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  47.75 
 
 
207 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.27 
 
 
188 aa  131  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 
188 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.11 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.86 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.38 
 
 
191 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  39.11 
 
 
189 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.3 
 
 
218 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  40.68 
 
 
190 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.8 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.8 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  48.09 
 
 
137 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  40 
 
 
196 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.43 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.66 
 
 
184 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.22 
 
 
184 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 
209 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  40.11 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.89 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  34.59 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 
193 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.67 
 
 
188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.67 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.89 
 
 
190 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.89 
 
 
190 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.89 
 
 
190 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.67 
 
 
190 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
179 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.25 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.8 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.23 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.98 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.57 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  54.46 
 
 
120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  41.08 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  42.25 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  40.54 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 
185 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.46 
 
 
179 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 
191 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.42 
 
 
191 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  35.42 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.87 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.68 
 
 
194 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.17 
 
 
185 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  35.16 
 
 
181 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  39.18 
 
 
197 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>