More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4734 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 242 aa  238  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  27.14 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  35.78 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  21.54 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  27.69 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  21.21 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  21.21 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  52.73 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  22.55 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>