76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4709 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.31 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  37.8 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.73 
 
 
232 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.93 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.83 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.17 
 
 
241 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.44 
 
 
240 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.44 
 
 
240 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.44 
 
 
240 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  42.86 
 
 
262 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.86 
 
 
237 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.28 
 
 
469 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.01 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.23 
 
 
234 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.89 
 
 
222 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.89 
 
 
222 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.63 
 
 
147 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.89 
 
 
222 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.7 
 
 
246 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  35.15 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.26 
 
 
232 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.06 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 
198 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.37 
 
 
225 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.82 
 
 
208 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.75 
 
 
237 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.16 
 
 
306 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.78 
 
 
185 aa  88.2  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.65 
 
 
405 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  29.25 
 
 
1027 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.43 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.17 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
390 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.53 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.24 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  31.79 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.76 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.76 
 
 
182 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.97 
 
 
399 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.39 
 
 
150 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.86 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.39 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 
157 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.5 
 
 
148 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  28 
 
 
148 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
154 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.49 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.81 
 
 
155 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.56 
 
 
193 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.97 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
988 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.85 
 
 
154 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.85 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  25.62 
 
 
176 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.83 
 
 
153 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.53 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.47 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.86 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.47 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.85 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.85 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 
154 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.37 
 
 
151 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.8 
 
 
213 aa  42  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>