More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4685 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 467 aa  924    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.81 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.97 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.38 
 
 		 393 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  39.05 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.05 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  37.37 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.57 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  36.57 
 
 		 402 aa  177  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  35.01 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 		 370 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.65 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.59 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.8 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.51 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.63 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.81 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  33.57 
 
 		 380 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.26 
 
 		 438 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.83 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.57 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  34.78 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.07 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.41 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  40.44 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  31.74 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.23 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.49 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.73 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.1 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  36.84 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.86 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.84 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  31.15 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.8 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.7 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  30.52 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  34.5 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  34.31 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.27 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.02 
 
 		 384 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 394 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32.35 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  34.7 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.8 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  33.24 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.24 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  31.87 
 
 		 388 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  32.2 
 
 		 397 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  37.87 
 
 		 351 aa  123  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.19 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  30.42 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.57 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  31.19 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  35.56 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.67 
 
 		 462 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  37.87 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  33.45 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  34.23 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  31.79 
 
 		 399 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 424 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  37.45 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  31.71 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 793 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 404 aa  117  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.31 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  32.87 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  31.63 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  32.45 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  32.89 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  31.66 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.84 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.17 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  31.99 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.06 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  30.43 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  33.33 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  30.56 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  36.18 
 
 		 393 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>