278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4659 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 655 aa  1348    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  89.92 
 
 		 825 aa  963    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  73.4 
 
 		 799 aa  760    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  49.9 
 
 		 829 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.71 
 
 		 794 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.27 
 
 		 837 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  34.27 
 
 		 815 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.78 
 
 		 808 aa  301  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.44 
 
 		 805 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.4 
 
 		 811 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  34.05 
 
 		 1015 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 		 806 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.59 
 
 		 882 aa  269  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 827 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  35.4 
 
 		 928 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3189  hypothetical protein  96.92 
 
 		 435 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.84 
 
 		 903 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 1355 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 873 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 807 aa  249  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.48 
 
 		 986 aa  249  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 		 919 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.52 
 
 		 1781 aa  242  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 806 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.64 
 
 		 922 aa  240  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 1185 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 858 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.08 
 
 		 824 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.45 
 
 		 813 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  28.97 
 
 		 859 aa  226  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 		 832 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  33.47 
 
 		 891 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.72 
 
 		 787 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.96 
 
 		 1093 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 984 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.21 
 
 		 805 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  32.13 
 
 		 932 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 925 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  39.41 
 
 		 604 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  27.47 
 
 		 961 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  29.56 
 
 		 964 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.15 
 
 		 750 aa  158  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.85 
 
 		 858 aa  158  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.34 
 
 		 862 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  30.69 
 
 		 785 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.38 
 
 		 897 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  28 
 
 		 894 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3247  hypothetical protein  54.47 
 
 		 435 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.27 
 
 		 781 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 781 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 888 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 743 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 979 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 803 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.4 
 
 		 913 aa  130  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3151  hypothetical protein  54.47 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  27.76 
 
 		 563 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.84 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.8 
 
 		 707 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.37 
 
 		 972 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 766 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.9 
 
 		 623 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 804 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.34 
 
 		 704 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 987 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.94 
 
 		 748 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25 
 
 		 804 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.22 
 
 		 1129 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.73 
 
 		 824 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 951 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.19 
 
 		 763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.49 
 
 		 920 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.68 
 
 		 747 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.85 
 
 		 741 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  29.41 
 
 		 603 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.78 
 
 		 848 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.15 
 
 		 1035 aa  107  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.43 
 
 		 596 aa  106  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.18 
 
 		 1024 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.12 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.39 
 
 		 1171 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.49 
 
 		 1041 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.7 
 
 		 920 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 1175 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 754 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  23.44 
 
 		 599 aa  101  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  25.13 
 
 		 1020 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.44 
 
 		 1030 aa  100  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  24.87 
 
 		 1043 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 		 1043 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.67 
 
 		 1455 aa  99  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.99 
 
 		 1005 aa  98.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.4 
 
 		 1026 aa  98.2  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.28 
 
 		 1013 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.94 
 
 		 738 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.8 
 
 		 992 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.49 
 
 		 568 aa  96.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 1079 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  31.15 
 
 		 1024 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.46 
 
 		 1063 aa  94.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>