More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4657 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 436 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  80.99 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  77.94 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  58.89 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  64.75 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  60.77 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.24 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  58.29 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  61.13 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  59.7 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  59.13 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  61 
 
 		 401 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  61.44 
 
 		 399 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  55.56 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  59.83 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  55.15 
 
 		 388 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  53.32 
 
 		 384 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  53.06 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  53.06 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  51.19 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  53.32 
 
 		 415 aa  279  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  50.4 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  38.74 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 		 403 aa  186  9e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  36.56 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 		 407 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.6 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.03 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.03 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.14 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.14 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  30.89 
 
 		 399 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.03 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  30.89 
 
 		 399 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.65 
 
 		 399 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.03 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.89 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.89 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.89 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.89 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 747 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 782 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 586 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 757 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 745 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.56 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.69 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.95 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.14 
 
 		 585 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.86 
 
 		 585 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 741 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 741 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.78 
 
 		 670 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 710 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 657 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 656 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 664 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 586 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.72 
 
 		 720 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 		 662 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.59 
 
 		 671 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 673 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 671 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 585 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  29.02 
 
 		 650 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  27.91 
 
 		 648 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  27.91 
 
 		 648 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  27.91 
 
 		 648 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.11 
 
 		 585 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 654 aa  99.8  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 741 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 		 659 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 674 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  27.83 
 
 		 556 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0387  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 565 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>