102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4656 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  316  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  81.25 
 
 		 160 aa  256  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  78.12 
 
 		 186 aa  245  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  62.5 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  60 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  60 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  58.13 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  55.62 
 
 		 196 aa  153  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  52.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  48.12 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  47.47 
 
 		 195 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  49.04 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  48.75 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  48.12 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  45 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  44.38 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  44.59 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  45.89 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  29.19 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  29.56 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  29.11 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  29.88 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  29.27 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  32.67 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  29.27 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  29.63 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  28.66 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  28.66 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  28.66 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  28.66 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  31.9 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  28.22 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  39.24 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  27.61 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  27.61 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  27.61 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  26.99 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  26.38 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  38.64 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  29.27 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  28.66 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 674 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 		 652 aa  54.3  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  26.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.38 
 
 		 350 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 		 662 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  32.97 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  32.97 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 664 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.85 
 
 		 658 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  40.32 
 
 		 656 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 673 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 693 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 		 671 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 666 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.85 
 
 		 697 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.11 
 
 		 671 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  38.1 
 
 		 581 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 666 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 668 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 		 672 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 		 400 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  34.29 
 
 		 720 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 676 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 667 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  42 
 
 		 541 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 564 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 201 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  31.88 
 
 		 333 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  26.79 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  26.09 
 
 		 401 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.57 
 
 		 663 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>