More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4644 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 416 aa  794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  56.16 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  54.73 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  48.74 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  46.35 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  58.92 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  43.03 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33 
 
 		 489 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.01 
 
 		 493 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  34.07 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  48.69 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  46.6 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  49.72 
 
 		 776 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.94 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  47.78 
 
 		 745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50.34 
 
 		 277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  41.99 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  41.99 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.94 
 
 		 567 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42.41 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  31.27 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  40.98 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.18 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.01 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  43.63 
 
 		 225 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  48.13 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  46.91 
 
 		 903 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  35.05 
 
 		 734 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.93 
 
 		 286 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  42.54 
 
 		 401 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.82 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  42.39 
 
 		 862 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.27 
 
 		 214 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  41.99 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 		 291 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.02 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.5 
 
 		 264 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.05 
 
 		 267 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.16 
 
 		 184 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.09 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  33.57 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  44.04 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  42.01 
 
 		 260 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  24.6 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  45.09 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.38 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 		 333 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  42.63 
 
 		 213 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  44.05 
 
 		 215 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 		 493 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 		 241 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  41.14 
 
 		 319 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.51 
 
 		 1033 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 336 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 336 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 		 241 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  37 
 
 		 448 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.45 
 
 		 227 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  44.79 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  44.22 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  41.71 
 
 		 273 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  43.01 
 
 		 278 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.92 
 
 		 213 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.81 
 
 		 219 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  38.28 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  46.97 
 
 		 175 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  47.95 
 
 		 216 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  40.68 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  40.68 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  40.53 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36.79 
 
 		 1191 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  46.2 
 
 		 203 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  45.15 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 		 225 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 		 256 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.12 
 
 		 268 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  37.99 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 239 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  29.84 
 
 		 949 aa  89.7  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  41.61 
 
 		 182 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 727 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.26 
 
 		 189 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  38.12 
 
 		 222 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  37 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.37 
 
 		 525 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  41.07 
 
 		 210 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  35.66 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 		 515 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>