36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4643 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  56.61 
 
 
511 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  73.33 
 
 
103 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3040  insertion element is466s transposase  66.14 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.76 
 
 
509 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.87 
 
 
353 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  38.76 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4509  insertion element is466s transposase  67.86 
 
 
56 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282585  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.88 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.44 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.44 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  50.68 
 
 
83 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.7 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.13 
 
 
562 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.1 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.1 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.1 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.1 
 
 
545 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.1 
 
 
545 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.1 
 
 
545 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.6 
 
 
378 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.3 
 
 
549 aa  58.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.58 
 
 
518 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  33.06 
 
 
118 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.37 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.37 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.37 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.37 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.37 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.37 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.11 
 
 
518 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.11 
 
 
518 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7030  transposase  39.02 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  21.69 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.39 
 
 
441 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>