84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4618 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 883 aa  1727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  39.7 
 
 		 473 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  39.73 
 
 		 474 aa  235  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  37.92 
 
 		 465 aa  228  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.38 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 		 455 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  37.1 
 
 		 464 aa  208  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  35.23 
 
 		 466 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 		 445 aa  201  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  32.59 
 
 		 442 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  32.31 
 
 		 445 aa  196  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  37.89 
 
 		 469 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  34.71 
 
 		 453 aa  191  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  37.67 
 
 		 469 aa  191  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.72 
 
 		 475 aa  191  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  35.22 
 
 		 470 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  34.79 
 
 		 456 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  36.62 
 
 		 444 aa  188  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  34.43 
 
 		 466 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  34.43 
 
 		 466 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  34.43 
 
 		 466 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  34.43 
 
 		 466 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  34.43 
 
 		 466 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  34.06 
 
 		 473 aa  181  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  34.21 
 
 		 466 aa  181  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.36 
 
 		 474 aa  180  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  34.83 
 
 		 455 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  33.92 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.86 
 
 		 443 aa  177  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.1 
 
 		 453 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.26 
 
 		 460 aa  174  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  33.04 
 
 		 479 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  32.03 
 
 		 470 aa  161  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.62 
 
 		 482 aa  160  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.06 
 
 		 468 aa  159  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  33.83 
 
 		 471 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.33 
 
 		 481 aa  150  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.14 
 
 		 460 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.14 
 
 		 460 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  31.09 
 
 		 467 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  30.84 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  34.22 
 
 		 462 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 480 aa  145  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30.13 
 
 		 499 aa  144  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 523 aa  138  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 485 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 478 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.89 
 
 		 478 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1751 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  30.91 
 
 		 454 aa  125  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  30.32 
 
 		 437 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.43 
 
 		 466 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.77 
 
 		 468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.67 
 
 		 468 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  31.19 
 
 		 439 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  28.46 
 
 		 447 aa  97.8  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  29.72 
 
 		 426 aa  96.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.41 
 
 		 506 aa  94.7  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  29.46 
 
 		 439 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  25.88 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  48.35 
 
 		 125 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  30.94 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  35.16 
 
 		 477 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  25.78 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  25.48 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  27.16 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  23.45 
 
 		 435 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  23.45 
 
 		 435 aa  64.3  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  24.75 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  23.79 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  26.53 
 
 		 452 aa  53.5  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  60.47 
 
 		 61 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  22.69 
 
 		 494 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1833  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43 
 
 		 982 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.465477  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  30.16 
 
 		 651 aa  48.9  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.09 
 
 		 500 aa  48.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.09 
 
 		 500 aa  48.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  41.05 
 
 		 239 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  26.77 
 
 		 633 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.35 
 
 		 608 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>