More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4567 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 254 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.6 
 
 		 253 aa  333  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  62.06 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  61.26 
 
 		 254 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  65.22 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.06 
 
 		 254 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  62.45 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  58.66 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  58.27 
 
 		 254 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.63 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.87 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  51.6 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.78 
 
 		 249 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.32 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.66 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.39 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.75 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  46.75 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  46.75 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 		 269 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  41.98 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  40.84 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  41.22 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  41.9 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 797 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 266 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>