224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4446 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  100 
 
 		 175 aa  351  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  85.14 
 
 		 228 aa  305  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  84.57 
 
 		 213 aa  304  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  85.14 
 
 		 213 aa  303  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  85.37 
 
 		 212 aa  289  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  84.15 
 
 		 236 aa  286  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  82.29 
 
 		 262 aa  275  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  82.84 
 
 		 169 aa  270  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  83.43 
 
 		 175 aa  267  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  86.25 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  74.29 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  73.71 
 
 		 236 aa  260  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  72 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  76.25 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  65.69 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  79.61 
 
 		 135 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  81.44 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  75.73 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  62.24 
 
 		 96 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2530  hypothetical protein  61.76 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  38.89 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  35.76 
 
 		 302 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  40 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  35.76 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  37.74 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  35.98 
 
 		 235 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  37.11 
 
 		 238 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 		 264 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  32.58 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  32.91 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  38.31 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  35.19 
 
 		 235 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  34.97 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  37.42 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  33.54 
 
 		 235 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  35 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  36.26 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4169  hypothetical protein  42.76 
 
 		 248 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  36.26 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  36.26 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 235 aa  99  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  34.38 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  34.38 
 
 		 235 aa  98.2  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 		 238 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  39.31 
 
 		 233 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  38.78 
 
 		 236 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  35.85 
 
 		 263 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  35.85 
 
 		 341 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  35.4 
 
 		 228 aa  91.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  35.4 
 
 		 228 aa  91.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  31.03 
 
 		 230 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 		 230 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 		 230 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  31.03 
 
 		 230 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  32.7 
 
 		 228 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  36.49 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  34.78 
 
 		 228 aa  89  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 236 aa  88.2  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  38.35 
 
 		 222 aa  87.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  34.38 
 
 		 236 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  35.48 
 
 		 250 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  35.48 
 
 		 250 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  30.97 
 
 		 346 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  30.17 
 
 		 232 aa  84.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  30.13 
 
 		 214 aa  84.3  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  30.13 
 
 		 208 aa  84.3  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  29.49 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  29.49 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  39.22 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  28.74 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  28.74 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  29.49 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  28.74 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  28.74 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  29.49 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  29.49 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>