54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4407 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  100 
 
 		 447 aa  861    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  46.42 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  46.83 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  49.67 
 
 		 563 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  44.48 
 
 		 599 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  39.24 
 
 		 499 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  42.6 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  46.09 
 
 		 410 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  45.82 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  45.82 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  36.32 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  39.74 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  45.96 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  44.48 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  42.07 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  40.56 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  44.81 
 
 		 484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  42.42 
 
 		 480 aa  212  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  46.65 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  38.68 
 
 		 513 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  40.11 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  46.55 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  40.27 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  39.44 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  35.15 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  44.91 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  30.36 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  29.19 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  34.83 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  38.89 
 
 		 345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  30.79 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  32.42 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  31.68 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  26.8 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  28.48 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  24.67 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  23.68 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  28.79 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  25.33 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  24.9 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  21.7 
 
 		 396 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  27.6 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  31.65 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  27.96 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  29.79 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.55 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  21.16 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  21.16 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  19.47 
 
 		 261 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  27.84 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  27.84 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  24.03 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  25.83 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  22.63 
 
 		 257 aa  43.1  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>