53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4385 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 83 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  85.45 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  85.45 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  83.64 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  83.64 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  81.82 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  81.82 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  81.82 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  81.82 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  81.82 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  73.02 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  76.79 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  78.85 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  78.85 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  68.18 
 
 		 76 aa  90.5  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  78 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  76.47 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  70.69 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  70.69 
 
 		 64 aa  84.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  68.52 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  68.97 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  72.22 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  75 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  68.97 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  67.86 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  74 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  67.92 
 
 		 72 aa  76.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  75 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  64.71 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  60.78 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  76.92 
 
 		 41 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  57.14 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  54.9 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  46.43 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  46 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  42 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  33.73 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  39.58 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  39.58 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5448  hypothetical protein  41.07 
 
 		 71 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>