More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4360 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  46.96 
 
 		 1788 aa  1144    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1636 aa  3257    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  47.81 
 
 		 1756 aa  1186    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  75.2 
 
 		 1637 aa  2383    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  70.64 
 
 		 1726 aa  2221    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  67.09 
 
 		 1649 aa  2008    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  72.74 
 
 		 1629 aa  2250    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  72.12 
 
 		 1643 aa  2249    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.41 
 
 		 1780 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.17 
 
 		 2051 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 		 1914 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 1932 aa  456  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.34 
 
 		 1805 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  28.73 
 
 		 1837 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 		 1644 aa  439  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  29.01 
 
 		 1922 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.42 
 
 		 1833 aa  436  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.47 
 
 		 1809 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  26.42 
 
 		 2361 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.9 
 
 		 1808 aa  437  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.19 
 
 		 1780 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.51 
 
 		 1845 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.48 
 
 		 1934 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 		 1908 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.33 
 
 		 1805 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  24.33 
 
 		 1850 aa  416  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.53 
 
 		 2279 aa  411  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.41 
 
 		 1774 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.34 
 
 		 1901 aa  413  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.54 
 
 		 2272 aa  410  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.68 
 
 		 1804 aa  403  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.59 
 
 		 1668 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.63 
 
 		 1663 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.51 
 
 		 2077 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 1942 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.42 
 
 		 2109 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.41 
 
 		 1836 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.66 
 
 		 1712 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.8 
 
 		 1797 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.67 
 
 		 1795 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.5 
 
 		 2303 aa  384  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.06 
 
 		 1811 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.08 
 
 		 2017 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.83 
 
 		 1697 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.27 
 
 		 1822 aa  353  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.01 
 
 		 1797 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.76 
 
 		 1794 aa  321  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.53 
 
 		 1885 aa  321  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.33 
 
 		 1739 aa  319  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 670 aa  315  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.33 
 
 		 1871 aa  313  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.09 
 
 		 1832 aa  311  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1685 aa  273  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.34 
 
 		 1685 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.59 
 
 		 1685 aa  255  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.95 
 
 		 1748 aa  251  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.62 
 
 		 1885 aa  246  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.59 
 
 		 1682 aa  239  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.19 
 
 		 1682 aa  229  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 1744 aa  221  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  29.93 
 
 		 1710 aa  181  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  49.21 
 
 		 422 aa  175  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 		 345 aa  172  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  44.74 
 
 		 344 aa  171  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  43.12 
 
 		 546 aa  171  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  44.97 
 
 		 346 aa  170  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1235 aa  166  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0411  PAS:GGDEF  48.52 
 
 		 317 aa  166  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  44.13 
 
 		 538 aa  166  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.71 
 
 		 352 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  46.03 
 
 		 512 aa  162  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  35.08 
 
 		 591 aa  162  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  47.87 
 
 		 410 aa  162  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  45.69 
 
 		 339 aa  162  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  44.97 
 
 		 327 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.13 
 
 		 341 aa  160  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45 
 
 		 461 aa  159  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 340 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 340 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 340 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  44.92 
 
 		 480 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  46.88 
 
 		 536 aa  159  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.41 
 
 		 330 aa  158  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 340 aa  158  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  45.51 
 
 		 583 aa  158  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  44.17 
 
 		 488 aa  157  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 359 aa  158  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.68 
 
 		 362 aa  158  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.49 
 
 		 355 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.83 
 
 		 1774 aa  158  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  27.2 
 
 		 620 aa  157  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.95 
 
 		 664 aa  156  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  40.86 
 
 		 641 aa  156  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.5 
 
 		 353 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  36.04 
 
 		 354 aa  156  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  36.04 
 
 		 354 aa  156  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 501 aa  155  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4314  diguanylate cyclase  46.49 
 
 		 379 aa  155  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0998  PleD  46.63 
 
 		 511 aa  154  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  41.97 
 
 		 462 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>