More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4324 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  100 
 
 
395 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  75.51 
 
 
427 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  71.39 
 
 
395 aa  591  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  71.17 
 
 
395 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  69.87 
 
 
395 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  49.37 
 
 
398 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  48.98 
 
 
396 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  48.72 
 
 
398 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  47.97 
 
 
408 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  48.12 
 
 
395 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  47.84 
 
 
398 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  46.45 
 
 
406 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  46.45 
 
 
406 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  46.85 
 
 
396 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  46.45 
 
 
418 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  46.84 
 
 
396 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  47.26 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  47.97 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  46.77 
 
 
394 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  47.01 
 
 
411 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  47.09 
 
 
401 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  47.09 
 
 
401 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  46.84 
 
 
401 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  45.45 
 
 
404 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  45.45 
 
 
404 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  45.45 
 
 
404 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  44.28 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  44.83 
 
 
397 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  44.83 
 
 
397 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  44.83 
 
 
397 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  47.58 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  45.41 
 
 
413 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  44.13 
 
 
403 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  44.36 
 
 
398 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  43.04 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  42.78 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  42.78 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  43.86 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  44.05 
 
 
402 aa  298  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  44.25 
 
 
392 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  41.96 
 
 
405 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  41.96 
 
 
401 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  41.96 
 
 
405 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  41.96 
 
 
405 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  42.11 
 
 
402 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  42.11 
 
 
402 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  42.11 
 
 
402 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  40.2 
 
 
405 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  40.2 
 
 
405 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  40.2 
 
 
405 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  41.6 
 
 
402 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  41.19 
 
 
412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  41.94 
 
 
387 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  42.28 
 
 
402 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  39.8 
 
 
400 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  39.8 
 
 
400 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  39.54 
 
 
400 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  41.22 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  40.3 
 
 
414 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  38.68 
 
 
400 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  37.97 
 
 
400 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  36.8 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  36.8 
 
 
335 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  38.2 
 
 
390 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  36.01 
 
 
774 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.06 
 
 
380 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  38.42 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35.36 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  38.42 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  38.42 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  38.48 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  35.68 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  37.87 
 
 
403 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  37.69 
 
 
405 aa  212  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  35.29 
 
 
412 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  36.63 
 
 
406 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.73 
 
 
388 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  34.44 
 
 
413 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  35.69 
 
 
409 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  35.49 
 
 
395 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.44 
 
 
411 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  32.72 
 
 
399 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.46 
 
 
404 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.42 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.97 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  37.7 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  32.83 
 
 
409 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  36.46 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  30.05 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  32.28 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.57 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.27 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.51 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  35.31 
 
 
390 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  36.97 
 
 
414 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  36.07 
 
 
414 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  37.19 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  37.19 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  34.29 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  34.29 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>