More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4283 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  227  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 113 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  71.68 
 
 		 113 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  48.62 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  48 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  42.98 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  43.36 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  54.41 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  37.82 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  45.21 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  36.84 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  33.94 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  35.14 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  36.04 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  33.03 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  44.44 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  30.19 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>