More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4278 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 411 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  52.71 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  51.22 
 
 		 433 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  46.65 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  52.11 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  46.72 
 
 		 418 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  48.55 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  32.97 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  33.89 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.9 
 
 		 493 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  31.8 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.45 
 
 		 489 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 		 180 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  32.59 
 
 		 250 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  39.04 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 		 576 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 233 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.98 
 
 		 277 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  32.59 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  41.28 
 
 		 1191 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  42.54 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  34.25 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.83 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  36.82 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  36.82 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 		 268 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 		 256 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  44 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.89 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.94 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  49.09 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  44.65 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.79 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.27 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.25 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  45.11 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  41.78 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  19.48 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.82 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1033 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.57 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  37.75 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  38.41 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  44.14 
 
 		 182 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  41.46 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  38.41 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  35.09 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  39.52 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  40.67 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  42.22 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  42.22 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  36.91 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  36.91 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40.29 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  41.46 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.98 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.51 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  38.41 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  35.33 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  30.15 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40.99 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  37.09 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  40.48 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.29 
 
 		 227 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 176 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 176 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 		 903 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  36.73 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.82 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.75 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.16 
 
 		 862 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  45.13 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.4 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  39.55 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  39.76 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>