More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4243 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.73 
 
 		 500 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 504 aa  968    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.34 
 
 		 519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.81 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.27 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.62 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.16 
 
 		 788 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.65 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.93 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.58 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.83 
 
 		 498 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 501 aa  355  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.38 
 
 		 498 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.23 
 
 		 499 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.62 
 
 		 503 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.11 
 
 		 512 aa  349  8e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.53 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.88 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.48 
 
 		 519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.66 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.19 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 487 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 527 aa  299  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.79 
 
 		 763 aa  299  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45 
 
 		 489 aa  294  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.76 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 491 aa  289  8e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.7 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.49 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  45.26 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.03 
 
 		 490 aa  276  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  40.42 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.12 
 
 		 496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.79 
 
 		 507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.68 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 534 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.99 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 		 474 aa  267  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.97 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  37.94 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  39.56 
 
 		 497 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.65 
 
 		 479 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 483 aa  249  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.96 
 
 		 482 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 		 757 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.33 
 
 		 487 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  39.48 
 
 		 454 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 733 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  39.25 
 
 		 492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.95 
 
 		 522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.9 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  40.62 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  38.18 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.16 
 
 		 506 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.99 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.99 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 		 543 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 529 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 482 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  38.03 
 
 		 529 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 529 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.5 
 
 		 583 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.75 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.75 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.83 
 
 		 498 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  36.12 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.51 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 		 1112 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.03 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  42.08 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 		 524 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.58 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  40.09 
 
 		 481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>