62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4234 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  100 
 
 		 402 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  41.01 
 
 		 470 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  40.28 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  37.18 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  37.18 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  37.29 
 
 		 444 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  39.84 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  43.32 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  36.94 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  35.28 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  36.72 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  41.09 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  34.68 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  35.96 
 
 		 428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  41.34 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  40.34 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  40.53 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  35.1 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  40.73 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  35.35 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  38.17 
 
 		 420 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  32.44 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  33.15 
 
 		 467 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  35.99 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  36.81 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  35.49 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  35.49 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  36.76 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.64 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  33.88 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  31.52 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  34.02 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  34.02 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  34.5 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  34.02 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  34.18 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  34.07 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  32.53 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  32.53 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  32.53 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  34.97 
 
 		 477 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.92 
 
 		 494 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  33.97 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  33.97 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  33.97 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  33.92 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  37.58 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  35.16 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  37.04 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.83 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  33.83 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  34.34 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  30.99 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  30.99 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  30.99 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  32.91 
 
 		 463 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  33.55 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.69 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  26.88 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  29.5 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.32718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>