150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4189 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  100 
 
 		 902 aa  1739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.35 
 
 		 832 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.57 
 
 		 813 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.88 
 
 		 748 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  49.65 
 
 		 776 aa  628  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  47.6 
 
 		 795 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.12 
 
 		 786 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  48.2 
 
 		 754 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.11 
 
 		 804 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.43 
 
 		 746 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  47.2 
 
 		 765 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.32 
 
 		 766 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  43.94 
 
 		 771 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.73 
 
 		 788 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  41.97 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  41.97 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  41.97 
 
 		 724 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  42.04 
 
 		 734 aa  502  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.89 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.36 
 
 		 767 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  39.28 
 
 		 742 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  39.35 
 
 		 742 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.97 
 
 		 757 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  42.62 
 
 		 874 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  41.22 
 
 		 726 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.6 
 
 		 732 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.26 
 
 		 741 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.84 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.1 
 
 		 693 aa  356  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  37.06 
 
 		 703 aa  350  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  48.74 
 
 		 829 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  34.45 
 
 		 799 aa  298  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  49.39 
 
 		 750 aa  289  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  45.72 
 
 		 759 aa  285  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  46.63 
 
 		 735 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.05 
 
 		 764 aa  280  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  41.09 
 
 		 759 aa  280  8e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  42.64 
 
 		 758 aa  278  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.76 
 
 		 758 aa  272  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.62 
 
 		 747 aa  260  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.26 
 
 		 732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  32.74 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.98 
 
 		 691 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.98 
 
 		 724 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  40.97 
 
 		 726 aa  211  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.87 
 
 		 706 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  39.28 
 
 		 706 aa  206  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  38.54 
 
 		 705 aa  197  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.44 
 
 		 705 aa  191  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  40.12 
 
 		 761 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.39 
 
 		 659 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  36.13 
 
 		 715 aa  164  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  44.44 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.79 
 
 		 670 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.73 
 
 		 715 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  41.41 
 
 		 666 aa  158  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  36.22 
 
 		 719 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  38.34 
 
 		 710 aa  155  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  39.32 
 
 		 695 aa  154  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.35 
 
 		 645 aa  153  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  39.29 
 
 		 727 aa  150  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  38.64 
 
 		 680 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  37.19 
 
 		 716 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.07 
 
 		 755 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.28 
 
 		 672 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.52 
 
 		 710 aa  147  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  38.72 
 
 		 692 aa  147  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  39.78 
 
 		 684 aa  145  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  34.42 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.69 
 
 		 679 aa  144  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.22 
 
 		 695 aa  140  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.87 
 
 		 728 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  36.82 
 
 		 717 aa  138  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  34.98 
 
 		 706 aa  128  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  34.98 
 
 		 706 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 689 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 689 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 689 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 689 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 689 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 691 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  34.91 
 
 		 691 aa  121  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  29.33 
 
 		 1048 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.48 
 
 		 689 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  24.75 
 
 		 760 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.17 
 
 		 763 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.86 
 
 		 763 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.39 
 
 		 861 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.12 
 
 		 716 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  28.7 
 
 		 768 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  29.67 
 
 		 702 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  30.36 
 
 		 755 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  31.37 
 
 		 753 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  30.8 
 
 		 776 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  30.8 
 
 		 776 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  26.28 
 
 		 787 aa  102  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  31.86 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  30.8 
 
 		 778 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>