More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4133 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  68.74 
 
 		 489 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  71.55 
 
 		 475 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  100 
 
 		 479 aa  954    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  70.06 
 
 		 473 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  70.06 
 
 		 473 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  72.33 
 
 		 477 aa  714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  69.2 
 
 		 489 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  70.06 
 
 		 473 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  67.37 
 
 		 475 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  65.82 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  66.81 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  62.47 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  43.7 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  43.57 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  46.12 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  42.8 
 
 		 488 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  43.56 
 
 		 497 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  45.79 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  43.41 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  42.77 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  45.42 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  42.39 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  42.24 
 
 		 526 aa  320  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  41.81 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  42.12 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  42.48 
 
 		 503 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  40.4 
 
 		 503 aa  289  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  41.1 
 
 		 567 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  42.94 
 
 		 522 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  40.33 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  39.31 
 
 		 490 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  40.75 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  38.74 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  41.44 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  34.81 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  40.17 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  38.95 
 
 		 578 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  38.34 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  34.18 
 
 		 483 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  38.81 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  40.3 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  37.55 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  37.55 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  40.2 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  38.16 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  38.38 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  37.5 
 
 		 518 aa  243  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  35.93 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  37.23 
 
 		 506 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  35.99 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  35.81 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  40.95 
 
 		 630 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  37.84 
 
 		 515 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.91 
 
 		 544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  37.55 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  38.45 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  34.2 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  40.11 
 
 		 552 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.23 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  36.76 
 
 		 548 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  36.76 
 
 		 548 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  36.99 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  39.44 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 548 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 548 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  38.03 
 
 		 611 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  36.79 
 
 		 550 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  38.73 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.46 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.46 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  37.18 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  36.79 
 
 		 550 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  37.18 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  37.18 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  37.57 
 
 		 574 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  35.92 
 
 		 546 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  33.93 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  40.35 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  38.59 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  36.04 
 
 		 574 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  36.81 
 
 		 547 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  40 
 
 		 529 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  40.91 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  38.35 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  37.63 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.58 
 
 		 500 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  36.99 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 		 571 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.4 
 
 		 505 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  37.91 
 
 		 540 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  35.14 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  38.68 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  37.99 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  37.64 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  37.99 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  38.9 
 
 		 498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  35.31 
 
 		 512 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  36.39 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>