More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4089 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 772 aa  1506    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  39.91 
 
 		 719 aa  337  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  61.59 
 
 		 737 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  59.17 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  44.27 
 
 		 1030 aa  284  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  50.51 
 
 		 892 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  44.69 
 
 		 1351 aa  283  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.65 
 
 		 716 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 		 850 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  55.92 
 
 		 807 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  55.27 
 
 		 682 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  45.43 
 
 		 1750 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  56.32 
 
 		 295 aa  246  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 		 552 aa  230  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  42.39 
 
 		 1763 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 		 770 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  45.63 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 2831 aa  185  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  48.77 
 
 		 863 aa  184  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 666 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  36.59 
 
 		 425 aa  177  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  37.04 
 
 		 963 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  36.26 
 
 		 439 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 		 763 aa  171  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.65 
 
 		 2296 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 		 612 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.37 
 
 		 579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  35.31 
 
 		 646 aa  167  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  40.77 
 
 		 1032 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.13 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  38.43 
 
 		 620 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  40.77 
 
 		 1032 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.98 
 
 		 1051 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 		 628 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  41.98 
 
 		 1057 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 691 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  42.02 
 
 		 1018 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 		 756 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 646 aa  162  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.78 
 
 		 692 aa  160  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.72 
 
 		 632 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  38.77 
 
 		 1053 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  38.26 
 
 		 604 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.11 
 
 		 645 aa  157  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.96 
 
 		 662 aa  157  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 596 aa  157  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.02 
 
 		 614 aa  157  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.4 
 
 		 627 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.39 
 
 		 520 aa  156  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  37.45 
 
 		 790 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.15 
 
 		 641 aa  155  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.3 
 
 		 499 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.76 
 
 		 598 aa  154  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  34.74 
 
 		 457 aa  154  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 		 450 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  41 
 
 		 583 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 520 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  40.46 
 
 		 655 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.59 
 
 		 1072 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  35.18 
 
 		 638 aa  153  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.52 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 675 aa  152  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 746 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 382 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 543 aa  150  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 		 607 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.37 
 
 		 1076 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.03 
 
 		 863 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  36.12 
 
 		 2350 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 		 1122 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.18 
 
 		 1072 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  37.55 
 
 		 625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.91 
 
 		 650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  39.71 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 301 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.8 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 381 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 		 316 aa  148  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.79 
 
 		 603 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  38.46 
 
 		 951 aa  148  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.01 
 
 		 682 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 		 658 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.43 
 
 		 907 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 706 aa  147  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 		 464 aa  147  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 		 612 aa  147  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 		 559 aa  147  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.03 
 
 		 1130 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.84 
 
 		 647 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.71 
 
 		 1292 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  36.16 
 
 		 661 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.46 
 
 		 700 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.95 
 
 		 627 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.23 
 
 		 668 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.71 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 503 aa  146  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 		 450 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.74 
 
 		 693 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>