65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4012 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4012  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 174 aa  337  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  52.43 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  52.43 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  52.43 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  45.19 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  61.64 
 
 		 178 aa  97.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  48.33 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  48.91 
 
 		 103 aa  95.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  43.9 
 
 		 114 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  40.19 
 
 		 148 aa  91.3  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  48.89 
 
 		 104 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  62.71 
 
 		 104 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  52.86 
 
 		 97 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  53.52 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  61.02 
 
 		 104 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  53.85 
 
 		 101 aa  84.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  48.57 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  35.37 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  48 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  51.92 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  46 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  51.02 
 
 		 66 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  57.45 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  53.19 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  46.55 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  41.51 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  55.32 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  57.45 
 
 		 95 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  51.06 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  44.9 
 
 		 69 aa  47.8  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  46.51 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  42.65 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  41.07 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  41.07 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  41.07 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  46.94 
 
 		 75 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.55 
 
 		 72 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  43.4 
 
 		 78 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.94 
 
 		 76 aa  44.7  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  52.5 
 
 		 87 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.94 
 
 		 74 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  44 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.94 
 
 		 74 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.94 
 
 		 74 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.32 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  36.23 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  41.3 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2073  molecular chaperone DnaK  27.33 
 
 		 655 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  44.68 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.75 
 
 		 76 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.75 
 
 		 76 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.75 
 
 		 76 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.67 
 
 		 71 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 104 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.71 
 
 		 72 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.67 
 
 		 75 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.44 
 
 		 71 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 64 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 64 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 64 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  53.49 
 
 		 98 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.94 
 
 		 70 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.94 
 
 		 70 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>