More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4000 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  627  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.91 
 
 
294 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.49 
 
 
296 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  37.23 
 
 
315 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.45 
 
 
289 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.07 
 
 
285 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.13 
 
 
303 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  43.14 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.76 
 
 
293 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  38.21 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.08 
 
 
304 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.97 
 
 
294 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  40.32 
 
 
189 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  30.83 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  38 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  42.01 
 
 
189 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  42.01 
 
 
189 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  46.85 
 
 
221 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  38.69 
 
 
189 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.97 
 
 
189 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  40.11 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  43.85 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  37.25 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  36.11 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  38.12 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.62 
 
 
105 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  34.17 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.05 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.98 
 
 
137 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.44 
 
 
107 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  34.13 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  37.11 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  39 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.75 
 
 
114 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.34 
 
 
107 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.51 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  40 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  31.73 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  45.45 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  37.58 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  45.31 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.56 
 
 
506 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  34.03 
 
 
175 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.94 
 
 
106 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
106 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  34.31 
 
 
106 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.62 
 
 
504 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  38.2 
 
 
561 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.8 
 
 
112 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  46.97 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.97 
 
 
506 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  33.59 
 
 
173 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
290 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  40.24 
 
 
521 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.48 
 
 
118 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.68 
 
 
102 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.54 
 
 
111 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.29 
 
 
109 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.69 
 
 
114 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
118 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
113 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.51 
 
 
100 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  41.03 
 
 
105 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  37.65 
 
 
102 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  35.8 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0406  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.29 
 
 
103 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.02 
 
 
116 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
518 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 
585 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
509 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
509 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.35 
 
 
101 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  33.55 
 
 
185 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  33.55 
 
 
185 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  32.94 
 
 
102 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
509 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.04 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.04 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.89 
 
 
185 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.11 
 
 
527 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  39.22 
 
 
108 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.92 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  34.38 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  32.43 
 
 
171 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  38.67 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.18 
 
 
109 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.03 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  37.58 
 
 
168 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.36 
 
 
604 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.17 
 
 
105 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>