More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3965 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 613 aa  1169    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  56.58 
 
 		 648 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  44.24 
 
 		 534 aa  359  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 		 580 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 949 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 958 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  32.52 
 
 		 852 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 		 958 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 839 aa  275  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  35.07 
 
 		 585 aa  273  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 936 aa  273  7e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 562 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  36.05 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  39.3 
 
 		 4342 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  38.52 
 
 		 4342 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.77 
 
 		 2791 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.04 
 
 		 4317 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.34 
 
 		 4317 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 586 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.91 
 
 		 2820 aa  253  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 947 aa  253  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.73 
 
 		 4317 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.23 
 
 		 4317 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.12 
 
 		 1067 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.84 
 
 		 563 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 962 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.41 
 
 		 4336 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 586 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.07 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.34 
 
 		 2997 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.01 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 		 1656 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.75 
 
 		 4318 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.67 
 
 		 3235 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.28 
 
 		 4336 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 586 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.41 
 
 		 4332 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 610 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 653 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.97 
 
 		 629 aa  239  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 596 aa  239  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 942 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 		 546 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 706 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.65 
 
 		 2250 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  31.84 
 
 		 573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  31.84 
 
 		 576 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 		 1474 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 725 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 587 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 		 629 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 725 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 600 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  36.11 
 
 		 7122 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  33.46 
 
 		 3231 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.65 
 
 		 1035 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 586 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.32 
 
 		 1776 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  31.35 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  36.72 
 
 		 755 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 701 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.8 
 
 		 2762 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 		 629 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 576 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 		 544 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 		 544 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  39.35 
 
 		 588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 		 629 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 		 629 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  39.35 
 
 		 635 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  31.11 
 
 		 563 aa  226  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  39.35 
 
 		 686 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 573 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 593 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 595 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  32.17 
 
 		 1801 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 991 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>