More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3964 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  75.76 
 
 		 429 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  100 
 
 		 423 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  52 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  47.34 
 
 		 405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  50.13 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  46.25 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  44.94 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  43.63 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  43.7 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  42.23 
 
 		 405 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  42.58 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.96 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.96 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  42.32 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.96 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  41.77 
 
 		 419 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  42.72 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.25 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  36.63 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.23 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  37.23 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  41.94 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  39.81 
 
 		 413 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.16 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  42.21 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  38.82 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.55 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  39.46 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  40.44 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.74 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  38.22 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  37.5 
 
 		 421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  40.63 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  40.8 
 
 		 410 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  38.41 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.41 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40.49 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.96 
 
 		 411 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  38.07 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.41 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  39.06 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.16 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.16 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.91 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.16 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  39.95 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.62 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.66 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.91 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.44 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.75 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.98 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.1 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.22 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.66 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.11 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.91 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.29 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  39.56 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.62 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  38.15 
 
 		 422 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  38.39 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  40.35 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  40.56 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.98 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  40 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.28 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.26 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  42.49 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.55 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  35.28 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.95 
 
 		 411 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.41 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  34.99 
 
 		 396 aa  236  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.72 
 
 		 399 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.6 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  36.61 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.11 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.8 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.04 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.9 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  34.65 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.14 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  36.78 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.46 
 
 		 405 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  35.34 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  35.34 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.48 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.54 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  41.03 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.87 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.56 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.47 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  39.34 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.03 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.18 
 
 		 388 aa  227  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  38.58 
 
 		 417 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.78 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.66 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.61 
 
 		 407 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>