More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3959 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 411 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  57.58 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  53.9 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  42.75 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  39.37 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  38.14 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  41.34 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  43.65 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  38.98 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  41.43 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  41.67 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  30.1 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  29.19 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  30.45 
 
 		 495 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  30.79 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  31.21 
 
 		 436 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  30.79 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.94 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.45 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  26.65 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.71 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  25.89 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  28.31 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  25.38 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.88 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  23.1 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  30.23 
 
 		 455 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  33.15 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.61 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0369  monooxygenase FAD-binding  27.11 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.3 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.38 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  25.44 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.78 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  26.35 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  27.82 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.18 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  31.46 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.5 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  34.29 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.61 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.12 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  27.95 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.12 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  30.51 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.48 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  29.94 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  27.75 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  27.75 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  29.78 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29.78 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  34.81 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  29.94 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  29.78 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  32.22 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  29.78 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  29.78 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75910  squalene epoxidase(monooxygenase), erosterol biosynthesis  24.77 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  24.63 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  24.63 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  29.94 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.51 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  37.04 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.42 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.11 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.78 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.71 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  27.16 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  24.19 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25.44 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>