68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3955 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.59 
 
 
218 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.55 
 
 
270 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  32.39 
 
 
283 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  32.21 
 
 
289 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  30.73 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  31.91 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  31.77 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  32.21 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  31.58 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  32.84 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  24.23 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  33.66 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  34.05 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 
281 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  34.02 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  23.56 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  36.41 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  32.2 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  31.82 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  30.81 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  23.56 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  30.58 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  23.56 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  23.56 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  23.04 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  23.56 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  31.19 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  31.72 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  31.35 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  22.83 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  30.2 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  29.58 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  22.28 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  30.5 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  30.77 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  33.76 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  29.57 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  29.57 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.57 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  31.69 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  29.47 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  29.65 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  29.59 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  29.61 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  28.88 
 
 
267 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  29.32 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  27.37 
 
 
300 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  27.18 
 
 
289 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  27.51 
 
 
326 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  27.94 
 
 
307 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 
319 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  25.42 
 
 
143 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  28.21 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  28.21 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  29.49 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
281 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  29.8 
 
 
333 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  31.07 
 
 
232 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  27.46 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  29.74 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  25.94 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4289  lipolytic protein G-D-S-L family  26.57 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000411893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  28.92 
 
 
225 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  25.5 
 
 
244 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>