More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3943 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  100 
 
 		 403 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  64.08 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.48 
 
 		 353 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.11 
 
 		 353 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.43 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  46.15 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  46.83 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  50.27 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.63 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.88 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  46.61 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  44.35 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  47.25 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  46.48 
 
 		 379 aa  322  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  46.56 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  46.07 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  50 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.09 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 374 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  49.18 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  45.68 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  45.68 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.55 
 
 		 365 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  47.41 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 		 365 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.97 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.4 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  47.41 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.22 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.85 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  43.78 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  47.32 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  46.17 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  47.89 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  46.91 
 
 		 338 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  46.87 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  45.01 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.2 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  46.85 
 
 		 352 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  47.28 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  46.96 
 
 		 349 aa  316  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  45.36 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  49.33 
 
 		 358 aa  315  6e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  48.52 
 
 		 360 aa  316  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  51.09 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  47.89 
 
 		 332 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  45.08 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 344 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  46.96 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.68 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  47.25 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  45.94 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  46.59 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.48 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  46.58 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.93 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  47.28 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  47.4 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  53.33 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  42.05 
 
 		 369 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  46.13 
 
 		 363 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 363 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  46.03 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  44.62 
 
 		 381 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  47.67 
 
 		 362 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  45.77 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  47.01 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  46.87 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  44.9 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  44.96 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  47.11 
 
 		 354 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  44.81 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  48.02 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  49.58 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  45.75 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  45.29 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  46.91 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  44.35 
 
 		 355 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  47.08 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  43.27 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  48.91 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.45 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  45.82 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  47.95 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  42.01 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  45.28 
 
 		 365 aa  310  4e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>