More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3940 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  100 
 
 
427 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  53.18 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  52 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  48.65 
 
 
416 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  42.5 
 
 
405 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  45.11 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  42.32 
 
 
417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.33 
 
 
407 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.33 
 
 
407 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.33 
 
 
407 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.99 
 
 
405 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.39 
 
 
402 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  46.73 
 
 
401 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  39.13 
 
 
419 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  40.69 
 
 
418 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.33 
 
 
405 aa  255  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.92 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.68 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.36 
 
 
410 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  41.12 
 
 
399 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  37.68 
 
 
412 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.23 
 
 
412 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  38.78 
 
 
417 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  37.75 
 
 
413 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  37.01 
 
 
421 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  40.36 
 
 
417 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40.35 
 
 
402 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.56 
 
 
410 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.59 
 
 
398 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.92 
 
 
414 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.58 
 
 
411 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  40.83 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.48 
 
 
399 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.9 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.16 
 
 
411 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  37.59 
 
 
417 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  34.17 
 
 
442 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  35.64 
 
 
422 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.28 
 
 
405 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.67 
 
 
411 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.17 
 
 
411 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.35 
 
 
412 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.71 
 
 
398 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.56 
 
 
420 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.52 
 
 
417 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  42.37 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  36.1 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.78 
 
 
436 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  37.43 
 
 
400 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.9 
 
 
414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.66 
 
 
411 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  34.4 
 
 
413 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.09 
 
 
392 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.66 
 
 
411 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.77 
 
 
412 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.96 
 
 
408 aa  219  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.76 
 
 
409 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.32 
 
 
407 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.1 
 
 
411 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.16 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.5 
 
 
388 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  36.04 
 
 
399 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.16 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.16 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  39.07 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.41 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  37.4 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  34.08 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.96 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.76 
 
 
407 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.76 
 
 
407 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.04 
 
 
421 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.25 
 
 
411 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  39.8 
 
 
402 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.58 
 
 
402 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  34.25 
 
 
396 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.59 
 
 
419 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  36.14 
 
 
439 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  39.69 
 
 
387 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.14 
 
 
402 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.84 
 
 
417 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.01 
 
 
404 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  34.99 
 
 
398 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.78 
 
 
400 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  33.15 
 
 
403 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.21 
 
 
407 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.15 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.96 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.33 
 
 
380 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  37.32 
 
 
430 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.37 
 
 
423 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  40.51 
 
 
459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  36.34 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.44 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  37.63 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  38.08 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  34.69 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>