78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3906 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  293  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  58.39 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  55.07 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  52.9 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  54.14 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  54.14 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  54.01 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  47.15 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  41.27 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.85 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  35.25 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  34.15 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  44.21 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  36.51 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  31.11 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  32.52 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  33.09 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  35.34 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  33.06 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  29.93 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  33.6 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  27.94 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  29.17 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.67 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.82 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  35.64 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  30.56 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  27.13 
 
 		 576 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3869  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal  0.266339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.78 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  32.03 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  26.32 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.467127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  27.18 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  24.19 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  26.45 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.54 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  25.96 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  25 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  29.49 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.04 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  25.53 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  26.27 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.17 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  26.42 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  28.43 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  34.95 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  25.24 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  24.47 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  25 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  27.84 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  22.83 
 
 		 130 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  29.66 
 
 		 176 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  20.72 
 
 		 143 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 413 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1813  hypothetical protein  26.32 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  29.21 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  30.38 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  26.12 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  23.26 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  26.89 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  27.55 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4152  hypothetical protein  32.23 
 
 		 406 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  25.37 
 
 		 148 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  23.62 
 
 		 130 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>