More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3887 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  44.83 
 
 		 1584 aa  1038    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.43 
 
 		 2376 aa  887    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 		 7210 aa  1332    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.78 
 
 		 3670 aa  960    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.39 
 
 		 3033 aa  1875    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  51.42 
 
 		 1602 aa  945    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.86 
 
 		 1402 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  56.24 
 
 		 1143 aa  865    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.61 
 
 		 1349 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  100 
 
 		 3158 aa  6047    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.98 
 
 		 2719 aa  955    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  51.41 
 
 		 2066 aa  814    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  44.18 
 
 		 1601 aa  1028    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 		 4111 aa  996    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  56.22 
 
 		 1071 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  51.39 
 
 		 2090 aa  987    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  39.83 
 
 		 2108 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  51.11 
 
 		 5255 aa  1305    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 		 2551 aa  745    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 1874 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 1656 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.59 
 
 		 1144 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.6 
 
 		 1587 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.2 
 
 		 4930 aa  1142    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.61 
 
 		 6768 aa  1224    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.65 
 
 		 2890 aa  703    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  47.91 
 
 		 3463 aa  1160    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 		 5400 aa  1107    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.95 
 
 		 2024 aa  1166    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.38 
 
 		 3252 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  46.45 
 
 		 5154 aa  1189    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 		 1832 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  50.85 
 
 		 1548 aa  1221    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  49.81 
 
 		 2846 aa  991    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  49 
 
 		 2081 aa  1322    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.99 
 
 		 1804 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  33.39 
 
 		 4165 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.52 
 
 		 7110 aa  1320    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  52.92 
 
 		 2107 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.1 
 
 		 2762 aa  812    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  54.84 
 
 		 3148 aa  856    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 		 3693 aa  1532    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  53.61 
 
 		 2126 aa  1072    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 		 1816 aa  948    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.91 
 
 		 3176 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 		 1559 aa  859    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  40.31 
 
 		 2085 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.5 
 
 		 1349 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  49.46 
 
 		 1820 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 2551 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  45.28 
 
 		 2847 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 		 1354 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.75 
 
 		 3254 aa  1482    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  56 
 
 		 1789 aa  1126    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.66 
 
 		 4080 aa  989    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.88 
 
 		 3493 aa  2100    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 		 4840 aa  1044    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 1837 aa  833    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.87 
 
 		 4478 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  46.57 
 
 		 3400 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.98 
 
 		 4183 aa  834    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 		 3693 aa  1532    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  50.87 
 
 		 4607 aa  981    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 		 2232 aa  731    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 		 3130 aa  1087    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.48 
 
 		 2880 aa  771    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  40.31 
 
 		 2085 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.34 
 
 		 2374 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 		 3676 aa  871    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  43.21 
 
 		 2477 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 		 3696 aa  898    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  47.75 
 
 		 2060 aa  798    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.21 
 
 		 1559 aa  862    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.2 
 
 		 2333 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 		 3092 aa  1932    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  53.6 
 
 		 2966 aa  1062    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  48.58 
 
 		 2367 aa  894    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.09 
 
 		 3101 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  57.11 
 
 		 1593 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.64 
 
 		 4575 aa  976    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.9 
 
 		 3355 aa  977    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  55.38 
 
 		 1924 aa  1034    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.78 
 
 		 1087 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.58 
 
 		 3874 aa  1209    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 		 3702 aa  1531    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  47.64 
 
 		 4151 aa  1165    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 		 2230 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 		 3645 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  40.31 
 
 		 2085 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  49.29 
 
 		 7279 aa  1974    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 		 1939 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  39.22 
 
 		 2225 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  46.84 
 
 		 3711 aa  1115    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  50.96 
 
 		 3408 aa  1104    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.7 
 
 		 3679 aa  1498    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.09 
 
 		 3494 aa  1352    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.54 
 
 		 1955 aa  1337    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  55.2 
 
 		 2113 aa  853    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.47 
 
 		 1337 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  55.98 
 
 		 1831 aa  1148    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>