More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3854 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.95 
 
 		 544 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 541 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  65.27 
 
 		 538 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60 
 
 		 539 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.76 
 
 		 539 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  84.54 
 
 		 541 aa  856    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  80.18 
 
 		 541 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  85.11 
 
 		 542 aa  872    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  60.85 
 
 		 540 aa  638    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 544 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 544 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 544 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  81.3 
 
 		 540 aa  831    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  79.78 
 
 		 541 aa  853    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  68.02 
 
 		 537 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  69.51 
 
 		 544 aa  726    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  80.68 
 
 		 547 aa  829    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  68.26 
 
 		 544 aa  717    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.81 
 
 		 542 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  65.84 
 
 		 546 aa  668    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 544 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 545 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 549 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  82.01 
 
 		 544 aa  849    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  62.99 
 
 		 553 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 544 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  93.67 
 
 		 540 aa  978    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  81.87 
 
 		 543 aa  852    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 544 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  62.83 
 
 		 536 aa  648    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 546 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  65.9 
 
 		 544 aa  689    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 544 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  67.94 
 
 		 527 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  62.93 
 
 		 543 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 544 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  67.42 
 
 		 549 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.51 
 
 		 542 aa  721    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  63.9 
 
 		 539 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 536 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 548 aa  654    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  83.27 
 
 		 541 aa  836    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 546 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  80.19 
 
 		 541 aa  831    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  89.2 
 
 		 540 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  95.01 
 
 		 542 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 538 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  65.65 
 
 		 538 aa  670    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  62.13 
 
 		 544 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 553 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.26 
 
 		 545 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 544 aa  690    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.3 
 
 		 538 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  80.18 
 
 		 541 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  66.3 
 
 		 539 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  68.45 
 
 		 540 aa  702    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 541 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  81.28 
 
 		 540 aa  859    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  62.96 
 
 		 542 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  61.38 
 
 		 539 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 539 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  80.49 
 
 		 542 aa  835    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 544 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.67 
 
 		 546 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  63.03 
 
 		 540 aa  636    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  84.54 
 
 		 540 aa  882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 541 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  100 
 
 		 545 aa  1061    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  66.79 
 
 		 547 aa  698    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  74.91 
 
 		 540 aa  791    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  69.14 
 
 		 540 aa  727    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  78.47 
 
 		 543 aa  835    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  82.25 
 
 		 545 aa  846    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  62.83 
 
 		 536 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  64.27 
 
 		 543 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 544 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  66.03 
 
 		 547 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  65.84 
 
 		 542 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  85.98 
 
 		 539 aa  894    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  68.51 
 
 		 541 aa  714    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.52 
 
 		 538 aa  669    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  81.66 
 
 		 546 aa  829    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  80.37 
 
 		 541 aa  841    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  84.73 
 
 		 540 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  64.5 
 
 		 545 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  67.75 
 
 		 541 aa  713    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  84.22 
 
 		 541 aa  897    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  80.18 
 
 		 541 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.84 
 
 		 539 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  80.55 
 
 		 541 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  67.84 
 
 		 541 aa  712    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  62.93 
 
 		 535 aa  645    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 550 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.52 
 
 		 538 aa  669    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  62.25 
 
 		 543 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.3 
 
 		 538 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  82.06 
 
 		 541 aa  835    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 541 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 538 aa  699    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0184  chaperonin GroEL  60.55 
 
 		 545 aa  647    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>