33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3850 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  348  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  50.63 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  47.79 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  40.88 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.45 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  43.12 
 
 		 161 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  45.32 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  46.62 
 
 		 161 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  46.62 
 
 		 161 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  46.62 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  41.72 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  38.85 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  40.69 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  41.33 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  45.74 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  38.81 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  40.65 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  34.46 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.84 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  32.86 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  34.75 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  29.68 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  32.9 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  30.14 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  36.21 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  31.25 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  30.61 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  31.69 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  33.76 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1815  integral-membrane protein  29.66 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  decreased coverage  0.00207179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>