More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3802 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  100 
 
 
325 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  55.76 
 
 
331 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.72 
 
 
323 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  53 
 
 
322 aa  342  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.83 
 
 
324 aa  342  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  55.14 
 
 
331 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  51.1 
 
 
323 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  57.58 
 
 
359 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  52.47 
 
 
331 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  54.87 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.68 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.09 
 
 
327 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.78 
 
 
354 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.05 
 
 
318 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.52 
 
 
341 aa  329  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.61 
 
 
335 aa  328  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  56.71 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.32 
 
 
325 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.11 
 
 
330 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.36 
 
 
337 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  52.79 
 
 
302 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  52.27 
 
 
331 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 
313 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  53.23 
 
 
350 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  53.77 
 
 
350 aa  322  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  51.79 
 
 
320 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  51.47 
 
 
320 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.29 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.7 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  52.49 
 
 
327 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  51.24 
 
 
326 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  47.74 
 
 
312 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.86 
 
 
320 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.3 
 
 
339 aa  315  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  50.16 
 
 
457 aa  315  8e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  50.33 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  49.67 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.14 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.53 
 
 
320 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.53 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.69 
 
 
319 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  51.52 
 
 
320 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
330 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.53 
 
 
320 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  51.75 
 
 
372 aa  308  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  50.83 
 
 
302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  50.47 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  49.84 
 
 
323 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.74 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.05 
 
 
306 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.05 
 
 
306 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  52.65 
 
 
328 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.33 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.46 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  51.8 
 
 
320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
302 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  53.16 
 
 
319 aa  301  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  55.12 
 
 
342 aa  301  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  46.41 
 
 
318 aa  301  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  52.48 
 
 
332 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 
306 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.68 
 
 
317 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  48.67 
 
 
313 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 
322 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.72 
 
 
325 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  49.83 
 
 
296 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  49.83 
 
 
296 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  47.2 
 
 
323 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  49.37 
 
 
336 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.43 
 
 
383 aa  291  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.08 
 
 
321 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.67 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.51 
 
 
309 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.51 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  47.87 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.62 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.37 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.37 
 
 
319 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  51.64 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  47.21 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  48.84 
 
 
320 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.27 
 
 
327 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.9 
 
 
305 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 
354 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  48.51 
 
 
358 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.27 
 
 
308 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  46.84 
 
 
305 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.27 
 
 
325 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  46.13 
 
 
340 aa  278  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.12 
 
 
310 aa  278  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.85 
 
 
319 aa  278  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  46.71 
 
 
305 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.92 
 
 
340 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  45.72 
 
 
326 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
318 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>