More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3637 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1285 aa  2536    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 
1279 aa  358  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 
1195 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
1298 aa  238  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
1526 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  30.64 
 
 
1238 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.57 
 
 
782 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
1596 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.97 
 
 
1914 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
1714 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
1313 aa  113  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 
454 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  26.8 
 
 
941 aa  105  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  32.57 
 
 
490 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
1288 aa  102  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 
636 aa  101  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
1261 aa  97.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.84 
 
 
1131 aa  97.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
1101 aa  97.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 
957 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 
809 aa  91.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
924 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.02 
 
 
771 aa  90.1  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
1105 aa  88.6  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 
991 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
1060 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.45 
 
 
725 aa  85.5  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.86 
 
 
787 aa  85.1  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.67 
 
 
999 aa  84.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  24.53 
 
 
467 aa  84.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  22.98 
 
 
812 aa  83.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
1333 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  23.61 
 
 
1180 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  24.54 
 
 
1104 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 
816 aa  79.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
911 aa  79  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
1025 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.42 
 
 
828 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 
852 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  20.6 
 
 
809 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
284 aa  77.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  29.44 
 
 
848 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  21 
 
 
1009 aa  76.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  26.81 
 
 
534 aa  76.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.4 
 
 
672 aa  75.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.43 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
767 aa  75.1  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1063 aa  73.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 
1290 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.83 
 
 
1039 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
1424 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 
885 aa  73.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.67 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
568 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
568 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
1215 aa  72.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.65 
 
 
2145 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.57 
 
 
1266 aa  72  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
1298 aa  72  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
751 aa  70.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  26.8 
 
 
362 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.17 
 
 
755 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
850 aa  70.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.71 
 
 
985 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.14 
 
 
1227 aa  69.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 
872 aa  69.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  27.38 
 
 
823 aa  68.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
1958 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 
975 aa  68.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
953 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
843 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1143  hypothetical protein  24.96 
 
 
1175 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 
1021 aa  67.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
3145 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.12 
 
 
810 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
923 aa  67  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  24.5 
 
 
910 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
878 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.74 
 
 
945 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
798 aa  65.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.18 
 
 
1104 aa  65.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
945 aa  65.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  22.95 
 
 
1050 aa  65.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.63 
 
 
667 aa  65.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  21.51 
 
 
844 aa  65.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 
971 aa  65.1  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
799 aa  65.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 
714 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 
1040 aa  64.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 
1029 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  26.58 
 
 
1689 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  30.07 
 
 
697 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
1450 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  23.32 
 
 
689 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  29.41 
 
 
835 aa  62.4  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.17 
 
 
1022 aa  62  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.6 
 
 
1404 aa  62  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1435 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>