197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3623 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 288 aa  348  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  58.74 
 
 		 288 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  55.94 
 
 		 288 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  56.38 
 
 		 285 aa  322  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  57.6 
 
 		 287 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  57.14 
 
 		 292 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  56.58 
 
 		 303 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  53.82 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  59.55 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  53.48 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  55.23 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 296 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  56.74 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  56.38 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  53.21 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  52.48 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.18 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  55.24 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  53.6 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  53.62 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  56.18 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  48.93 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  49.82 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  47.7 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  45.39 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  47.69 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  46.35 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  48.79 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 289 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  39.64 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  40.7 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  36.86 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  37.76 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  39.3 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  41.15 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  39.42 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  41.77 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  38.43 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.34 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  37.77 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  40.33 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  38.49 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  37.13 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  38.43 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  38.31 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  35.46 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  35.99 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.88 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  36.47 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  35.13 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.3 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.79 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  35.34 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.07 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  35.54 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  35.07 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  32.1 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  40.22 
 
 		 212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  34.05 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  35.05 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  38.08 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  35.41 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  34.2 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 		 270 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.1 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  30.45 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  30.48 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  32.96 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.36 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  29.76 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>