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for query gene Franean1_3555 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 527 aa  1001    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.37 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.57 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.16 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.28 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.25 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  39.52 
 
 		 519 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 522 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.28 
 
 		 478 aa  256  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.13 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.06 
 
 		 489 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  36.14 
 
 		 582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.82 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 587 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37 
 
 		 551 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.31 
 
 		 510 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 		 528 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  36.63 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 553 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.71 
 
 		 502 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 		 521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 		 500 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.1 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 484 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 478 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 		 498 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.28 
 
 		 541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 519 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.26 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.93 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 		 551 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  33.06 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 		 763 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.83 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.25 
 
 		 527 aa  211  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 521 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 513 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 607 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 		 474 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.27 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 		 487 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 512 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  35.9 
 
 		 537 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.22 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 574 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 		 458 aa  203  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 485 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
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NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
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NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
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NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 524 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.52 
 
 		 543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
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NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
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NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.87 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.49 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
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NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
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