132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3549 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  100 
 
 		 285 aa  560  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  70.28 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  68.77 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  68.18 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  66.78 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  66.78 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  66.78 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  66.78 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  66.78 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  66.43 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  65.03 
 
 		 286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  65.03 
 
 		 286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  65.95 
 
 		 287 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  65.23 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  65.23 
 
 		 292 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  63.29 
 
 		 286 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  64.69 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  65.59 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  65.59 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  65.03 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  64.34 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  64.03 
 
 		 285 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  42.91 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 630 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 630 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 648 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 659 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  35.98 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 604 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  36.46 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 639 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  35.07 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  41.94 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  34.6 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  34.6 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  36.02 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  34.12 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  41.04 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  34.6 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  35.07 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  39.52 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  28.41 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  28.33 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  33.97 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  31.56 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  32.52 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  32.73 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  36.3 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  31.25 
 
 		 307 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  29.13 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  29.38 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  26.98 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  26.15 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  38.36 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  38.36 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  38.36 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  37.91 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  27.97 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  34 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  25.62 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  33.54 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  35.71 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  41.27 
 
 		 300 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  41.27 
 
 		 300 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  41.27 
 
 		 300 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  30.66 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  33.72 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  39.69 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  24.55 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  41.23 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  41.23 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  41.23 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  36.65 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  37.14 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  35.37 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  33.73 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  36.09 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  30.38 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  33.82 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  34.69 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  34.71 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  34.69 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  42.11 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  36.96 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  31.19 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  32.51 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  36.23 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  36.23 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  38.1 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  38.85 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  32.31 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  32.31 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0567855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>