27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3512 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3512  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  65.79 
 
 
158 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  65.79 
 
 
158 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  65.79 
 
 
158 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  61.44 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  61.44 
 
 
159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  34.23 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  30.82 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  30.32 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  27.81 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  32.7 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  31.25 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  31.97 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  24.75 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  27.08 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  28.48 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  28.76 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  27.81 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  27.81 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  27.81 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  26.9 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  30.58 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  29.82 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.58 
 
 
148 aa  42  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  30.71 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  25.99 
 
 
184 aa  41.2  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>