More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3482 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  46.8 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 209 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.55 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 207 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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